Strain Data

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Strain number NIES-1105  
Phylum Cyanophyta  
Class Cyanophyceae  
Scientific name Microcystis aeruginosa (Kützing) Lemmermann  
Synonym Microcystis ichthyoblabe Kützing; Microcystis novacekii (Komárek) Compère; Microcystis viridis (A.Brown) Lemmermann; Microcystis wesenbergii Komárek  
Former name Microcystis ichthyoblabe Kützing  
Common name Blue-green alga ; Cyanobacteria  
Locality (Date of collection) Lake Barato, Sapporo, Hokkaido, Japan (1989-08-02)  
Latitude / Longitude  
Habitat (Isolation source) Freshwater (Lake water)  
History < TAC;  
Isolator (Date of isolation) Watanabe, Masayuki (1989-08-02)  
Identified by Watanabe, Masayuki  
State of strain Cryopreservation; Unialgal; Clonal; Non-axenic  
Culture condition
(Preculture condition) 		Medium:  MA  
Temperature:  18 C
Light intensity:  15-25 µmol photons/m2/sec, L/D cycle:  10L:14D
Duration:  1 M  
Gene information 16S rRNA ( AB015368 AB023283 ) , ftsZ ( AB324880 ) , glnA ( AB324959 ) , gltX ( AB325038 ) , gyrB ( AB325117 ) , pgi ( AB325196 ) , recA ( AB325275 ) , tpi ( AB325354 ) , ITS ( AB015368 ) , rpoC1 ( AB333821 )  
Cell size (min - max) - 5 μm  
Organization  
Characteristics Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Reisolated from TAC 125 ; ST31 (Tanabe et al. 2007)  
Other strain no. Other strain no. : TAC 125-1  
Remarks Cryopreserved; Toxicity 
Movie  
Related strain information
(Large number of orders and same genus or species)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-298
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST60 (Tanabe et al. 2007) ; Draft genome sequence (Rhee et al. 2012)  
NIES-44
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Okano et al. 2015)  
NIES-87
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2018)  
NIES-843
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Planktonic ; Type strain (Otsuka et al. 2001) ; Genome decoded strain (Kaneko et al. 2007) ; ST18 (Tanabe et al. 2007)  
NIES-102
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2020) ; ST10 (Tanabe et al. 2007)  
Related strain information
(Whose relevance due to simultaneous purchases and other information is inferred by AI)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-88
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST3 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Parajuli et al. 2016)  
NIES-90
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST5 (Tanabe et al. 2007)  
Related strain information
(Used in same reference)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-1125
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST27 (Tanabe, Y. eet al. 2007)  
NIES-1227
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Reservoir water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST72 (Tanabe, Y. et al. 2007)  
NIES-1090
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; microcystin (-) ; Reisolated from TAC 91 ; ST2 (Tanabe et al. 2007)  
NIES-2478
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator, Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST100 (Tanabe, Y. et al. 2009b)  
NIES-27
 		Spirulina subsalsa Blue-green alga ; Cyanobacteria    
Reference
Kondo, R., Kagiya, G., Hiroishi, S., Watanabe, M. 2000 Genetic typing of a bloom-forming cyanobacterial genus Microcystis in Japan using 16S rRNA gene sequence analysis. Plankton Biol. Ecol., 47, 1-6.
Keywords: genetic typing; 16S rDNA; Microcystis; cyanobacteria; phylogenetic analysis
Strain(s): 87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  104,  105,  106,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  604,  1055,  1061,  1068,  1076,  1090,  1091,  1105,  1122,  1142,  1164 

Kondo, R., Kagiya, G., Hiroishi, S., Watanabe, M., Hata, Y. 1999 Rapid DNA extraction from a bloom-forming cyanobacterium. Microbes Environ., 14, 157-161.
Keywords: DNA extraction; PCR; Microcystis; cyanobacteria
Strain(s): 87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  104,  105,  106,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  604,  1055,  1061,  1068,  1076,  1090,  1091,  1105,  1122,  1142,  1164 
DOI: 10.1264/jsme2.14.157

Kondo, R., Kagiya, G., Komura, M., Yuki, Y., Hiroishi, S., Watanabe, M. 2000 Molecular taxonomy of a bloom-forming cyanobacterial genus Microcystis. Bull. Plankton Soc. Japan, 47, 25-33 (in Japanese with English summary).
Keywords: cyanobacteria; Microcystis; bacterial criteria; molecular analysis
Strain(s): 6,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  104,  105,  106,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  604,  1055,  1061,  1068,  1076,  1090,  1091,  1105,  1122,  1142,  1164 

Nishihara, H., Miwa, H., Watanabe, M., Nagashima, M., Yagi, O., Takamura, Y. 1997 Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analyses for discriminating genotypes of Microcystis cyanobacteria. Biosci. Biotechnol. Biochem., 61, 1067-1072.
Keywords: RAPD analysis; DNA polymorphism; Microcystis; cyanobacterium; allozyme genotype
Strain(s): 1061,  1067,  1068,  1076,  1077,  1090,  1091,  1105,  1122,  1133,  1142,  1164 
PubMed: 9255968
DOI: 10.1271/bbb.61.1067

Otsuka, S., Suda, S., Li, R., Watanabe, M., Oyaizu, H., Matsumoto, S., Watanabe, M. M. 1999 Phylogenetic relationships between toxic and non-toxic strains of the genus Microcystis based on 16S to 23S internal transcribed spacer sequence. FEMS Mircobiol. Lett., 172, 15-21.
Keywords: cyanobacteria; Microcystis; internal transcribed spacer; phylogeny; microcystin
Strain(s): 44,  104,  111,  1054,  1055,  1058,  1067,  1068,  1072,  1085,  1086,  1090,  1091,  1092,  1105,  1115,  1117,  1143 
PubMed: 10079523
DOI: 10.1111/j.1574-6968.1999.tb13443.x

Watanabe, M. 1996 Isolation, cultivation and classification of bloom-forming Microcystis in Japan. In Toxic Microcystis, Eds. by Watanabe, M.F., Harada, K., Carmichael W.W. & Fujii, H., CRC Press, Boca Raton, pp. 13-34.
Strain(s): 1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1061,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1070,  1071,  1072,  1074,  1075,  1076,  1077,  1079,  1080,  1081,  1082,  1083,  1085,  1086,  1087,  1088,  1089,  1090,  1093,  1095,  1097,  1098,  1099,  1105,  1107,  1108,  1109,  1110,  1113,  1115,  1116,  1117,  1122,  1124,  1125,  1126,  1127,  1130,  1132,  1133,  1134,  1139,  1140,  1141,  1142,  1146,  1147,  1149,  1152,  1153,  1154,  1155,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1173,  1178,  1182,  1183,  1184,  1187,  1189,  1194,  1196,  1198,  1200,  1203,  1205,  1206,  1209,  1213,  1216,  1219,  1222,  1225,  1230,  1232,  1234,  1237,  1239,  1241,  1243,  1246 

Tanabe, Y., Kasai, F., Watanabe, M. M. 2007 Multilocus sequence typing (MLST) reveals high genetic diversity and clonal population structure of the toxic cyanobacterium Microcystis aeruginosa. Microbiology, 153, 3695-3703.
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  933,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254 
PubMed: 17975077
DOI: 10.1099/mic.0.2007/010645-0

Tanabe, Y., Sano, T., Kasai, F., Watanabe, M. M. 2009b Recombination, cryptic clades and neutral molecular divergence of the microcystin synthetase (mcy) genes of toxic cyanobacterium Microcystis aeruginosa. BMC Evol. Biol., 9, 115 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254,  2465,  2466,  2467,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2561 
PubMed: 19463155
DOI: 10.1186/1471-2148-9-115

Tanabe, Y. & Watanabe, M. M. 2011 Local expansion of a panmictic lineage of water bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa. PLoS One, 6, e17085 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1173,  1174,  1175,  1176,  1177,  1179,  1180,  1181,  1183,  1184,  1185,  1186,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254,  2088,  2089,  2090,  2091,  2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2493,  2494,  2495,  2496,  2542,  2543,  2544,  2545,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2591,  2592,  2593,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2609,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2627,  2628,  2629 
PubMed: 21390221
DOI: 10.1371/journal.pone.0017085

Kuno, S., Yoshida, T., Kamikawa, R., Hosoda, N., Sako, Y. 2010 The distribution of a phage-related insertion sequence element in the cyanobacterium, Microcystis aeruginosa. Microbes Environ., 25, 295-301.
Keywords: cyanobacteria; Microcystis; cyanophage; insertion sequence; horizontal gene transfer
Strain(s): 90,  91,  98,  99,  101,  102,  112,  298,  604,  843,  1058,  1067,  1070,  1086,  1098,  1105 
DOI: 10.1264/jsme2.ME10125

Yoshida, M., Yoshida, T., Satomi, M., Takashima, Y., Hosoda, N., Hiroishi, S. 2008 Intra-specific phenotypic and genotypic variation in toxic cyanobacterial Microcystis aeruginosa. J. Appl. Phycol., 105, 407-415.
Keywords: API ZYM; diversity; microcystin; Microcystis; phylogeny; population; taxonomy; toxic; cyanobacteria
Strain(s): 101,  102,  103,  112,  298,  604,  1055,  1058,  1062,  1070,  1091,  1105 
DOI: 10.1111/j.1365-2672.2008.03754.x

Sun, L.W., Jiang, W.J., Sato, H., Kawachi, M., Lu, X.W. 2016 Rapid classification and identification of Microcystis aeruginosa strains using MALDI-TOF MS and polygenetic analysis. PLoS One, 11, e0156275 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  100,  101,  104,  105,  107,  109,  111,  112,  478,  604,  843,  901,  1043,  1053,  1058,  1061,  1068,  1069,  1070,  1072,  1076,  1077,  1085,  1094,  1099,  1101,  1104,  1105,  1113,  1115,  1126,  1134,  1135,  1144,  1151,  1157,  1170,  1211,  1213,  1215,  1216,  1217,  1218,  1222,  1224,  1230,  1232,  1233,  1239 
PubMed: 27227555
DOI: 10.1371/journal.pone.0156275

Tanabe, Y., Hodoki, Y., Sano, T., Tada, K., Watanabe, MM. 2018a Adaptation of the freshwater bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa to brackish water is driven by recent horizontal transfer of sucrose genes. Front. Microbiol., 9, 1150 (article ID).
Keywords: Microcystis; bloom; salt tolerance; sucrose; genomics; brackish water; horizontal gene trasnfer; ecotype
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  107,  108,  109,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1052,  1059,  1063,  1067,  1069,  1070,  1075,  1076,  1085,  1093,  1094,  1098,  1100,  1101,  1102,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1128,  1130,  1131,  1132,  1134,  1139,  1141,  1142,  1143,  1144,  1150,  1170,  1174,  1175,  1176,  1177,  1179,  1181,  1183,  1185,  1211,  1213,  1214,  1215,  1232,  1234,  1238,  1239,  1252,  2088,  2090,  2091,  2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2494,  2495,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2592,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2628,  2629,  4234 
PubMed: 29922255
DOI: 10.3389/fmicb.2018.01150

Asukabe, H., Akahori, S., Ueno, E., Nakayama, T., Yamashita, R., Arii, S., Harada, K., Imanishi, S. Y. 2020 Cyanobacterial classification with the toxicity using MALDI Biotyper. J. Am. Soc. Mass Spectrom., 31, 1572-1578.
Keywords: cyanobacteria; MALDI Biotyper; microcystins; profiling
Strain(s): 27,  39,  42,  73,  81,  87,  89,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  107,  111,  112,  207,  208,  230,  266,  298,  416,  433,  478,  510,  512,  515,  592,  593,  604,  611,  808,  809,  835,  843,  846,  847,  905,  928,  931,  932,  945,  981,  989,  1025,  1043,  1058,  1061,  1064,  1068,  1069,  1071,  1076,  1085,  1099,  1101,  1105,  1113,  1115,  1126,  1133,  1134,  1135,  1144,  1157,  1215,  1642,  1643,  1652,  1668,  1672,  1673,  1677,  1678,  1698,  2087,  2131,  2412,  2665,  3708,  3733,  3734,  3736,  3755,  3756,  3757 
PubMed: 32501712
DOI: 10.1021/jasms.0c00148

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