Strain Data

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Strain number NIES-1115  
Phylum Cyanophyta  
Class Cyanophyceae  
Scientific name Microcystis aeruginosa (Kützing) Lemmermann  
Synonym Microcystis ichthyoblabe Kützing; Microcystis novacekii (Komárek) Compère; Microcystis viridis (A.Brown) Lemmermann; Microcystis wesenbergii Komárek  
Former name  
Common name Blue-green alga ; Cyanobacteria  
Locality (Date of collection) Showa-tameike Pond, Yame, Fukuoka, Japan (1989-08-28)  
Latitude / Longitude 33.22527777 / 130.52694444 
Habitat (Isolation source) Freshwater (Pond water)  
History < TAC;  
Isolator (Date of isolation) Watanabe, Masayuki (1989-08-28)  
Identified by Watanabe, Masayuki  
State of strain Cryopreservation; Unialgal; Clonal; Non-axenic  
Culture condition
(Preculture condition) 		Medium:  MA  
Temperature:  18 C
Light intensity:  15-25 µmol photons/m2/sec, L/D cycle:  10L:14D
Duration:  1 M  
Gene information 16S rRNA ( AB015369 ) , ftsZ ( AB324893 ) , glnA ( AB324972 ) , gltX ( AB325051 ) , gyrB ( AB325130 ) , pgi ( AB325209 ) , recA ( AB325288 ) , tpi ( AB325367 )  
Cell size (min - max) - 5 μm  
Organization  
Characteristics Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Reisolated from TAC 136 ; ST44 (Tanabe, Y. et al. 2007)  
Other strain no. Other strain no. : TAC 136-1  
Remarks Cryopreserved 
Movie  
Related strain information
(Large number of orders and same genus or species)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-298
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST60 (Tanabe et al. 2007) ; Draft genome sequence (Rhee et al. 2012)  
NIES-44
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Okano et al. 2015)  
NIES-87
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2018)  
NIES-843
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Planktonic ; Type strain (Otsuka et al. 2001) ; Genome decoded strain (Kaneko et al. 2007) ; ST18 (Tanabe et al. 2007)  
NIES-102
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2020) ; ST10 (Tanabe et al. 2007)  
Related strain information
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Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-98
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; microcystin (-) ; ST6 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2016)  
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(Used in same reference)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-2091
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST173 (Tanabe et al. 2011)  
NIES-1025
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Pond water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Asukabe et al. 2020) ; Planktonic  
NIES-1643
 		Sphaerospermopsis aphanizomenoides Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Pond water) Planktonic  
NIES-2606
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator ; Probably non-toxic ; ST216 (Tanabe et al. 2011)  
NIES-110
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST1 (Tanabe et al. 2007)  
Reference
Otsuka, S., Suda, S., Li, R., Watanabe, M., Oyaizu, H., Matsumoto, S., Watanabe, M. M. 1999 Phylogenetic relationships between toxic and non-toxic strains of the genus Microcystis based on 16S to 23S internal transcribed spacer sequence. FEMS Mircobiol. Lett., 172, 15-21.
Keywords: cyanobacteria; Microcystis; internal transcribed spacer; phylogeny; microcystin
Strain(s): 44,  104,  111,  1054,  1055,  1058,  1067,  1068,  1072,  1085,  1086,  1090,  1091,  1092,  1105,  1115,  1117,  1143 
PubMed: 10079523
DOI: 10.1111/j.1574-6968.1999.tb13443.x

Watanabe, M. 1996 Isolation, cultivation and classification of bloom-forming Microcystis in Japan. In Toxic Microcystis, Eds. by Watanabe, M.F., Harada, K., Carmichael W.W. & Fujii, H., CRC Press, Boca Raton, pp. 13-34.
Strain(s): 1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1061,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1070,  1071,  1072,  1074,  1075,  1076,  1077,  1079,  1080,  1081,  1082,  1083,  1085,  1086,  1087,  1088,  1089,  1090,  1093,  1095,  1097,  1098,  1099,  1105,  1107,  1108,  1109,  1110,  1113,  1115,  1116,  1117,  1122,  1124,  1125,  1126,  1127,  1130,  1132,  1133,  1134,  1139,  1140,  1141,  1142,  1146,  1147,  1149,  1152,  1153,  1154,  1155,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1173,  1178,  1182,  1183,  1184,  1187,  1189,  1194,  1196,  1198,  1200,  1203,  1205,  1206,  1209,  1213,  1216,  1219,  1222,  1225,  1230,  1232,  1234,  1237,  1239,  1241,  1243,  1246 

Tanabe, Y., Kasai, F., Watanabe, M. M. 2007 Multilocus sequence typing (MLST) reveals high genetic diversity and clonal population structure of the toxic cyanobacterium Microcystis aeruginosa. Microbiology, 153, 3695-3703.
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  933,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254 
PubMed: 17975077
DOI: 10.1099/mic.0.2007/010645-0

Tanabe, Y., Sano, T., Kasai, F., Watanabe, M. M. 2009b Recombination, cryptic clades and neutral molecular divergence of the microcystin synthetase (mcy) genes of toxic cyanobacterium Microcystis aeruginosa. BMC Evol. Biol., 9, 115 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254,  2465,  2466,  2467,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2561 
PubMed: 19463155
DOI: 10.1186/1471-2148-9-115

Tanabe, Y. & Watanabe, M. M. 2011 Local expansion of a panmictic lineage of water bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa. PLoS One, 6, e17085 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1173,  1174,  1175,  1176,  1177,  1179,  1180,  1181,  1183,  1184,  1185,  1186,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254,  2088,  2089,  2090,  2091,  2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2493,  2494,  2495,  2496,  2542,  2543,  2544,  2545,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2591,  2592,  2593,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2609,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2627,  2628,  2629 
PubMed: 21390221
DOI: 10.1371/journal.pone.0017085

Sun, L.W., Jiang, W.J., Sato, H., Kawachi, M., Lu, X.W. 2016 Rapid classification and identification of Microcystis aeruginosa strains using MALDI-TOF MS and polygenetic analysis. PLoS One, 11, e0156275 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  100,  101,  104,  105,  107,  109,  111,  112,  478,  604,  843,  901,  1043,  1053,  1058,  1061,  1068,  1069,  1070,  1072,  1076,  1077,  1085,  1094,  1099,  1101,  1104,  1105,  1113,  1115,  1126,  1134,  1135,  1144,  1151,  1157,  1170,  1211,  1213,  1215,  1216,  1217,  1218,  1222,  1224,  1230,  1232,  1233,  1239 
PubMed: 27227555
DOI: 10.1371/journal.pone.0156275

Tanabe, Y., Hodoki, Y., Sano, T., Tada, K., Watanabe, MM. 2018a Adaptation of the freshwater bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa to brackish water is driven by recent horizontal transfer of sucrose genes. Front. Microbiol., 9, 1150 (article ID).
Keywords: Microcystis; bloom; salt tolerance; sucrose; genomics; brackish water; horizontal gene trasnfer; ecotype
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  107,  108,  109,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1052,  1059,  1063,  1067,  1069,  1070,  1075,  1076,  1085,  1093,  1094,  1098,  1100,  1101,  1102,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1128,  1130,  1131,  1132,  1134,  1139,  1141,  1142,  1143,  1144,  1150,  1170,  1174,  1175,  1176,  1177,  1179,  1181,  1183,  1185,  1211,  1213,  1214,  1215,  1232,  1234,  1238,  1239,  1252,  2088,  2090,  2091,  2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2494,  2495,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2592,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2628,  2629,  4234 
PubMed: 29922255
DOI: 10.3389/fmicb.2018.01150

Asukabe, H., Akahori, S., Ueno, E., Nakayama, T., Yamashita, R., Arii, S., Harada, K., Imanishi, S. Y. 2020 Cyanobacterial classification with the toxicity using MALDI Biotyper. J. Am. Soc. Mass Spectrom., 31, 1572-1578.
Keywords: cyanobacteria; MALDI Biotyper; microcystins; profiling
Strain(s): 27,  39,  42,  73,  81,  87,  89,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  107,  111,  112,  207,  208,  230,  266,  298,  416,  433,  478,  510,  512,  515,  592,  593,  604,  611,  808,  809,  835,  843,  846,  847,  905,  928,  931,  932,  945,  981,  989,  1025,  1043,  1058,  1061,  1064,  1068,  1069,  1071,  1076,  1085,  1099,  1101,  1105,  1113,  1115,  1126,  1133,  1134,  1135,  1144,  1157,  1215,  1642,  1643,  1652,  1668,  1672,  1673,  1677,  1678,  1698,  2087,  2131,  2412,  2665,  3708,  3733,  3734,  3736,  3755,  3756,  3757 
PubMed: 32501712
DOI: 10.1021/jasms.0c00148

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