Strain Data
Strain number NIES-2519  
Phylum Cyanophyta  
Class Cyanophyceae  
Scientific name Microcystis aeruginosa (Kützing) Lemmermann  
Synonym Microcystis ichthyoblabe Kützing; Microcystis novacekii (Komárek) Compère; Microcystis viridis (A.Brown) Lemmermann; Microcystis wesenbergii Komárek  
Former name  
Common name Blue-green alga ; Cyanobacteria  
Locality (Date of collection) Lake Kitaura, Hokota, Ibaraki, Japan (2005-08-14)  
Latitude / Longitude 36.12194444 / 140.53222222 
Habitat (Isolation source) Freshwater (Lake water)  
History < Tanabe, Yuuhiko  
Isolator (Date of isolation) Tanabe, Yuuhiko (2005-08-20)  
Identified by Tanabe, Yuuhiko  
State of strain Cryopreservation; Unialgal; Clonal; Non-axenic  
Culture condition
(Preculture condition) 		Medium:  MA  
Temperature:  20 C
Light intensity:  10 µmol photons/m2/sec, L/D cycle:  10L:14D
Duration:  1 M  
Gene information Whole-genome ( BHVO01000000 ) , ftsZ ( AB511571 ) , gltX ( AB511623 ) , gyrB ( AB511650 ) , pgi ( AB511666 ) , tpi ( AB511698 )  
Cell size (min - max)  
Organization  
Characteristics Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator ; Genome decoded strain (Tanabe et al. 2026) ; ST145 (Tanabe et al. 2011) ; Phycoerythrin-containing strain (Tanabe et al. 2018b)  
Other strain no. Other strain no. : Ki05YA01  
Remarks Cryopreserved 
Movie  
Related strain information
(Large number of orders and same genus or species)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-298
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST60 (Tanabe et al. 2007) ; Draft genome sequence (Rhee et al. 2012)  
NIES-44
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Okano et al. 2015)  
NIES-87
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2018)  
NIES-843
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Planktonic ; Type strain (Otsuka et al. 2001) ; Genome decoded strain (Kaneko et al. 2007) ; ST18 (Tanabe et al. 2007)  
NIES-102
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2020) ; ST10 (Tanabe et al. 2007)  
Related strain information
(Used in same reference)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-1098
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Reservoir water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; microcystin (-) ; Reisolated from TAC 110 ; ST38 (Tanabe et al. 2007)  
NIES-2493
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator ; Probably non-toxic ; ST135 (Tanabe et al. 2009a)  
NIES-111
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST14 (Tanabe et al. 2007)  
NIES-110
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST1 (Tanabe et al. 2007)  
NIES-2480
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator ; ST109 (Tanabe et al. 2009a)  
Reference
Tanabe, Y., Kasai, F., Watanabe, M. M. 2009a Fine-scale spatial and temporal genetic differentiation　of water bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa: revealed by multilocus sequence typing. Environ. Microbiol. Rep., 1, 575-582.
Strain(s): 2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2493,  2494,  2495,  2496,  2519,  2520,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2592,  2593,  2594,  2617,  2618 
PubMed: 23765937
DOI: 10.1111/j.1758-2229.2009.00088.x

Tanabe, Y. 2010 "Biological species recognition" within the toxic cyanobacterium Microcystis. IFO Res. Commun., 24, 69-79 (in Japanese with English summary).
Keywords: Microcystis; MLST; microcystin synthetase; recombination; biological species recognition
Strain(s): 2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2493,  2494,  2495,  2496,  2519,  2520,  2521,  2522,  2542,  2543,  2544,  2545,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2591,  2592,  2593,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2609,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2627,  2628,  2629 

Tanabe, Y. & Watanabe, M. M. 2011 Local expansion of a panmictic lineage of water bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa. PLoS One, 6, e17085 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1173,  1174,  1175,  1176,  1177,  1179,  1180,  1181,  1183,  1184,  1185,  1186,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254,  2088,  2089,  2090,  2091,  2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2493,  2494,  2495,  2496,  2519,  2520,  2521,  2522,  2542,  2543,  2544,  2545,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2591,  2592,  2593,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2609,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2627,  2628,  2629 
PubMed: 21390221
DOI: 10.1371/journal.pone.0017085

Tanabe, Y.. & Yamaguchi, H. 2018b Evolutionary history of phycoerythrin pigmentation in the water bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa. bioRXiv
Strain(s): 1211,  2519,  2520,  2521,  2522,  4234,  4264 
DOI: 10.1101/485508

Tanabe, Y., Yamaguchi, H., Sano, T. 2026 Phylogenomic diversity and chromatic acclimation in phycoerythrin-containing Microcystis aeruginosa. Microb. Genomics, 12, 001852 (article ID).
Keywords: chromatic acclimation; cyanobacteria; ecotype; microcystis; phycoerythrin; phylogenomics
Strain(s): 2519,  2520,  2521,  2522,  4264 
PubMed: 42808883
DOI: 10.1099/mgen.0.001852

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