Strain Data
Strain number NIES-2520  
Phylum Cyanophyta  
Class Cyanophyceae  
Scientific name Microcystis aeruginosa (Kützing) Lemmermann  
Synonym Microcystis ichthyoblabe Kützing; Microcystis novacekii (Komárek) Compère; Microcystis viridis (A.Brown) Lemmermann; Microcystis wesenbergii Komárek  
Former name  
Common name Blue-green alga ; Cyanobacteria  
Locality (Date of collection) Lake Teganuma, Kashiwa, Chiba, Japan (2005-09-10)  
Latitude / Longitude 35.85072222 / 140.06583333 
Habitat (Isolation source) Freshwater (Lake water)  
History < Tanabe, Yuuhiko  
Isolator (Date of isolation) Tanabe, Yuuhiko (2005-09-13)  
Identified by Tanabe, Yuuhiko  
State of strain Cryopreservation; Unialgal; Clonal; Non-axenic  
Culture condition
(Preculture condition) 		Medium:  MA  
Temperature:  20 C
Light intensity:  10 µmol photons/m2/sec, L/D cycle:  10L:14D
Duration:  1 M  
Gene information Whole-genome ( BHVP00000000 ) , ftsZ ( AB465830 ) , glnA ( AB465831 ) , gltX ( AB465832 ) , gyrB ( AB465833 ) , pgi ( AB465834 ) , recA ( AB465835 ) , tpi ( AB465836 ) , mcyD ( AB444764 ) , mcyG ( AB444805 ) , mcyJ ( AB444846 )  
Cell size (min - max)  
Organization  
Characteristics Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator, Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Genome decoded strain (Tanabe et al. 2026) ; ST93 (Tanabe, Y. et al. 2009b) ; Phycoerythrin-containing strain (Tanabe et al. 2018b)  
Other strain no. Other strain no. : Tn05AK01  
Remarks Cryopreserved; Toxicity 
Movie  
Related strain information
(Large number of orders and same genus or species)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-298
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST60 (Tanabe et al. 2007) ; Draft genome sequence (Rhee et al. 2012)  
NIES-44
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Okano et al. 2015)  
NIES-87
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2018)  
NIES-843
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Planktonic ; Type strain (Otsuka et al. 2001) ; Genome decoded strain (Kaneko et al. 2007) ; ST18 (Tanabe et al. 2007)  
NIES-102
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2020) ; ST10 (Tanabe et al. 2007)  
Related strain information
(Used in same reference)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-2480
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator ; ST109 (Tanabe et al. 2009a)  
NIES-1217
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Reservoir water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST71 (Tanabe, Y. et al. 2007)  
NIES-91
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST77 (Tanabe et al. 2007)  
NIES-1240
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Reservoir water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST79 (Tanabe, Y. et al. 2007)  
NIES-1070
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Pond water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Reisolated from TAC 69 ; ST36 (Tanabe et al. 2007)  
Reference
Tanabe, Y., Kasai, F., Watanabe, M. M. 2009a Fine-scale spatial and temporal genetic differentiation　of water bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa: revealed by multilocus sequence typing. Environ. Microbiol. Rep., 1, 575-582.
Strain(s): 2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2493,  2494,  2495,  2496,  2519,  2520,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2592,  2593,  2594,  2617,  2618 
PubMed: 23765937
DOI: 10.1111/j.1758-2229.2009.00088.x

Tanabe, Y., Sano, T., Kasai, F., Watanabe, M. M. 2009b Recombination, cryptic clades and neutral molecular divergence of the microcystin synthetase (mcy) genes of toxic cyanobacterium Microcystis aeruginosa. BMC Evol. Biol., 9, 115 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254,  2465,  2466,  2467,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2520,  2561 
PubMed: 19463155
DOI: 10.1186/1471-2148-9-115

Tanabe, Y. 2010 "Biological species recognition" within the toxic cyanobacterium Microcystis. IFO Res. Commun., 24, 69-79 (in Japanese with English summary).
Keywords: Microcystis; MLST; microcystin synthetase; recombination; biological species recognition
Strain(s): 2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2493,  2494,  2495,  2496,  2519,  2520,  2521,  2522,  2542,  2543,  2544,  2545,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2591,  2592,  2593,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2609,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2627,  2628,  2629 

Tanabe, Y. & Watanabe, M. M. 2011 Local expansion of a panmictic lineage of water bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa. PLoS One, 6, e17085 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1173,  1174,  1175,  1176,  1177,  1179,  1180,  1181,  1183,  1184,  1185,  1186,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254,  2088,  2089,  2090,  2091,  2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2493,  2494,  2495,  2496,  2519,  2520,  2521,  2522,  2542,  2543,  2544,  2545,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2591,  2592,  2593,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2609,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2627,  2628,  2629 
PubMed: 21390221
DOI: 10.1371/journal.pone.0017085

Tanabe, Y.. & Yamaguchi, H. 2018b Evolutionary history of phycoerythrin pigmentation in the water bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa. bioRXiv
Strain(s): 1211,  2519,  2520,  2521,  2522,  4234,  4264 
DOI: 10.1101/485508

Hu, W., Teng, Y., Wang, X., Xu, Y., Sun, Y., Wang, H., Li, Y., Dai, S., Zhong, M., Luo, Y. 2025 Mixotrophic cyanobacteria are critical active diazotrophs in polychlorinated biphenyl-contaminated paddy soil. ISME Commun., 5, ycae160 (article ID).
Keywords: active diazotrophs; cyanobacteria; PCB contamination; paddy soil
Strain(s): 2520,  4074 
PubMed: 40114670
DOI: 10.1093/ismeco/ycae160

Tanabe, Y., Yamaguchi, H., Sano, T. 2026 Phylogenomic diversity and chromatic acclimation in phycoerythrin-containing Microcystis aeruginosa. Microb. Genomics, 12, 001852 (article ID).
Keywords: chromatic acclimation; cyanobacteria; ecotype; microcystis; phycoerythrin; phylogenomics
Strain(s): 2519,  2520,  2521,  2522,  4264 
PubMed: 42808883
DOI: 10.1099/mgen.0.001852

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