Strain Data
Strain number NIES-2479  
Phylum Cyanophyta  
Class Cyanophyceae  
Scientific name Microcystis aeruginosa (Kützing) Lemmermann  
Synonym Microcystis ichthyoblabe Kützing; Microcystis novacekii (Komárek) Compère; Microcystis viridis (A.Brown) Lemmermann; Microcystis wesenbergii Komárek  
Former name  
Common name Blue-green alga ; Cyanobacteria  
Locality (Date of collection) Lake Kasumigaura, Tsuchiura, Ibaraki, Japan (2004-09-01)  
Latitude / Longitude 36.07944444 / 140.20888888 
Habitat (Isolation source) Freshwater (Lake water)  
History < Tanabe, Yuuhiko  
Isolator (Date of isolation) Tanabe, Yuuhiko (2004-**-**)  
Identified by Tanabe, Yuuhiko  
State of strain Cryopreservation; Unialgal; Clonal; Non-axenic  
Culture condition
(Preculture condition) 		Medium:  MA  
Temperature:  20 C
Light intensity:  15-25 µmol photons/m2/sec, L/D cycle:  10L:14D
Duration:  1 M  
Gene information ftsZ ( AB465746 ) , glnA ( AB465747 ) , gltX ( AB465748 ) , gyrB ( AB465749 ) , pgi ( AB465750 ) , recA ( AB465751 ) , tpi ( AB465752 ) , mcyD ( AB444756 ) , mcyG ( AB444797 ) , mcyJ ( AB444838 )  
Cell size (min - max)  
Organization  
Characteristics Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator, Toxicity ; ST81 (Tanabe et al. 2009b)  
Other strain no. Other strain no. : KA-4  
Remarks Cryopreserved; Toxicity 
Movie  
Related strain information
(Large number of orders and same genus or species)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-298
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST60 (Tanabe et al. 2007) ; Draft genome sequence (Rhee et al. 2012)  
NIES-44
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Okano et al. 2015)  
NIES-87
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2018)  
NIES-843
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Planktonic ; Type strain (Otsuka et al. 2001) ; Genome decoded strain (Kaneko et al. 2007) ; ST18 (Tanabe et al. 2007)  
NIES-102
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2020) ; ST10 (Tanabe et al. 2007)  
Related strain information
(Whose relevance due to simultaneous purchases and other information is inferred by AI)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-98
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; microcystin (-) ; ST6 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2016)  
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(Used in same reference)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-2617
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator ; Toxicity ; ST141 (Tanabe et al. 2011)  
NIES-1185
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Pond water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST194 (Tanabe et al. 2011)  
NIES-2620
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator ; ST127 (Tanabe et al. 2011)  
NIES-2487
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator ; ST118 (Tanabe et al. 2009a)  
NIES-2612
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator ; Probably non-toxic ; ST228 (Tanabe et al. 2011)  
Reference
Tanabe, Y., Kasai, F., Watanabe, M. M. 2009a Fine-scale spatial and temporal genetic differentiation　of water bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa: revealed by multilocus sequence typing. Environ. Microbiol. Rep., 1, 575-582.
Strain(s): 2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2493,  2494,  2495,  2496,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2592,  2593,  2594,  2617,  2618 
PubMed: 23765937
DOI: 10.1111/j.1758-2229.2009.00088.x

Tanabe, Y., Sano, T., Kasai, F., Watanabe, M. M. 2009b Recombination, cryptic clades and neutral molecular divergence of the microcystin synthetase (mcy) genes of toxic cyanobacterium Microcystis aeruginosa. BMC Evol. Biol., 9, 115 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254,  2465,  2466,  2467,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2561 
PubMed: 19463155
DOI: 10.1186/1471-2148-9-115

Tanabe, Y. 2010 "Biological species recognition" within the toxic cyanobacterium Microcystis. IFO Res. Commun., 24, 69-79 (in Japanese with English summary).
Keywords: Microcystis; MLST; microcystin synthetase; recombination; biological species recognition
Strain(s): 2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2493,  2494,  2495,  2496,  2542,  2543,  2544,  2545,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2591,  2592,  2593,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2609,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2627,  2628,  2629 

Tanabe, Y. & Watanabe, M. M. 2011 Local expansion of a panmictic lineage of water bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa. PLoS One, 6, e17085 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1173,  1174,  1175,  1176,  1177,  1179,  1180,  1181,  1183,  1184,  1185,  1186,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254,  2088,  2089,  2090,  2091,  2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2493,  2494,  2495,  2496,  2542,  2543,  2544,  2545,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2591,  2592,  2593,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2609,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2627,  2628,  2629 
PubMed: 21390221
DOI: 10.1371/journal.pone.0017085

Tanabe, Y., Hodoki, Y., Sano, T., Tada, K., Watanabe, MM. 2018a Adaptation of the freshwater bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa to brackish water is driven by recent horizontal transfer of sucrose genes. Front. Microbiol., 9, 1150 (article ID).
Keywords: Microcystis; bloom; salt tolerance; sucrose; genomics; brackish water; horizontal gene trasnfer; ecotype
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  107,  108,  109,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1052,  1059,  1063,  1067,  1069,  1070,  1075,  1076,  1085,  1093,  1094,  1098,  1100,  1101,  1102,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1128,  1130,  1131,  1132,  1134,  1139,  1141,  1142,  1143,  1144,  1150,  1170,  1174,  1175,  1176,  1177,  1179,  1181,  1183,  1185,  1211,  1213,  1214,  1215,  1232,  1234,  1238,  1239,  1252,  2088,  2090,  2091,  2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2494,  2495,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2592,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2628,  2629,  4234 
PubMed: 29922255
DOI: 10.3389/fmicb.2018.01150

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