Strain Data
Strain number NIES-478  
Phylum Cyanophyta  
Class Cyanophyceae  
Scientific name Microcystis aeruginosa (Kützing) Lemmermann  
Synonym Microcystis ichthyoblabe Kützing; Microcystis novacekii (Komárek) Compère; Microcystis viridis (A.Brown) Lemmermann; Microcystis wesenbergii Komárek  
Former name Microcystis aeruginosa (Kützing) Lemmermann f. flos-aquae (Wittrock) Elenkin  
Common name Blue-green alga ; Cyanobacteria  
Locality (Date of collection) Lake Kasumigaura, Ibaraki, Japan (1977-09-**)  
Latitude / Longitude 36.0428477398 / 140.373233439 
Habitat (Isolation source) Freshwater (Lake water)  
History < Yagi, Osami  
Isolator (Date of isolation) Yagi, Osami (1978-04-**)  
Identified by Yagi, Osami  
State of strain Cryopreservation; Unialgal; Non-clonal; Non-axenic  
Culture condition
(Preculture condition) 		Medium:  MA  
Temperature:  20 (25) C
Light intensity:  4-10 (12) µmol photons/m2/sec, L/D cycle:  10L:14D
Duration:  3 M (14 D)  
Gene information ftsZ ( AB324911 ) , glnA ( AB324990 ) , gltX ( AB325069 ) , gyrB ( AB325148 ) , mcyJ ( AB444827 ) , pgi ( AB325227 ) , recA ( AB325306 ) , tpi ( AB325385 )  
Cell size (min - max)  
Organization  
Characteristics Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST62 (Tanabe et al. 2007)  
Other strain no. Other strain no. : K-5  
Remarks Cryopreserved; Toxicity 
Movie  
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(Large number of orders and same genus or species)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-298
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST60 (Tanabe et al. 2007) ; Draft genome sequence (Rhee et al. 2012)  
NIES-44
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Okano et al. 2015)  
NIES-87
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2018)  
NIES-843
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Planktonic ; Type strain (Otsuka et al. 2001) ; Genome decoded strain (Kaneko et al. 2007) ; ST18 (Tanabe et al. 2007)  
NIES-102
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2020) ; ST10 (Tanabe et al. 2007)  
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Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-88
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST3 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Parajuli et al. 2016)  
NIES-90
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST5 (Tanabe et al. 2007)  
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(Used in same reference)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-1231
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Reservoir water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST78 (Tanabe, Y. et al. 2007)  
NIES-597
 		Planktothrix spiroides Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Pond water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; Planktonic  
NIES-2626
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator ; Probably non-toxic ; ST219 (Tanabe et al. 2011)  
NIES-1146
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST39 (Tanabe, Y. et al. 2007)  
NIES-724
 		Eudorina unicocca Green alga   Freshwater Phototaxis ; Heterothallic  
Reference
Ishida, K., Matsuda, H., Murakami, M., Yamaguchi, K. 1997 Micropeptins 478-A and -B, plasmin inhibitors from the cyanobacterium Microcystis aeruginosa. J. Nat. Prod., 60, 184-187.
Strain(s): 478 
DOI: 10.1021/np9606815

Mori, F., Erata, M., Watanabe, M. M. 2002 Cryopreservation of cyanobacteria and green algae in the NIES-Collection. Microbiol. Cult. Coll., 18, 45-55.
Keywords: cryopreservation; cyanobacteria; green algae; FDA staining method; NIES-Collection
Strain(s): 19,  21,  22,  23,  24,  25,  26,  27,  28,  29,  30,  31,  32,  33,  34,  35,  36,  37,  38,  39,  40,  41,  44,  45,  46,  50,  51,  52,  53,  54,  55,  56,  58,  59,  60,  61,  62,  63,  64,  65,  66,  67,  68,  69,  70,  73,  74,  75,  76,  77,  78,  79,  80,  81,  87,  89,  90,  91,  92,  93,  94,  95,  96,  97,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  119,  120,  122,  123,  125,  127,  128,  129,  130,  131,  132,  133,  134,  135,  137,  138,  139,  144,  147,  151,  152,  153,  154,  155,  156,  157,  158,  159,  160,  162,  163,  164,  165,  166,  167,  168,  170,  171,  172,  173,  174,  175,  176,  177,  178,  179,  180,  181,  182,  183,  185,  186,  187,  188,  189,  191,  192,  193,  194,  197,  198,  199,  200,  201,  202,  203,  204,  205,  206,  207,  208,  209,  210,  211,  212,  213,  214,  215,  216,  217,  224,  226,  227,  228,  229,  230,  231,  232,  241,  242,  243,  244,  245,  246,  248,  257,  259,  261,  263,  266,  267,  268,  287,  288,  289,  290,  294,  295,  297,  298,  299,  300,  301,  302,  303,  305,  306,  308,  309,  310,  312,  313,  329,  334,  337,  338,  339,  340,  341,  342,  349,  351,  359,  360,  361,  362,  375,  378,  379,  380,  382,  384,  385,  390,  394,  396,  397,  398,  415,  416,  418,  419,  421,  422,  423,  424,  425,  426,  427,  428,  429,  430,  431,  432,  433,  434,  436,  437,  438,  439,  440,  446,  447,  448,  449,  450,  451,  452,  453,  454,  455,  456,  457,  458,  459,  460,  464,  468,  469,  474,  478,  479,  480,  481,  503,  504,  505,  506,  507,  509,  510,  512,  514,  515,  522,  523,  524,  527,  528,  529,  530,  531,  532,  536,  537,  538,  539,  540,  541,  542,  543,  544,  545,  546,  564,  565,  566,  567,  568,  569,  570,  571,  572,  573,  574,  575,  576,  577,  578,  579,  580,  581,  582,  583,  584,  585,  592,  593,  594,  595,  596,  597,  598,  604,  610,  628,  630,  631,  632,  633,  634,  635,  636,  637,  638,  639,  640,  641,  642,  643,  644,  645,  646,  647,  648,  649,  650,  651,  652,  653,  654,  655,  656,  657,  658,  659,  660,  661,  662,  663,  664,  665,  666,  667,  672,  685,  686,  687,  688,  689,  690,  691,  692,  693,  694,  717,  718,  719,  720,  721,  722,  723,  724,  725,  726,  727,  728,  729 

Yagi, O., Hagiwara, T., Takamura, Y., Sudo, R. 1984 Growth characteristics of axenic and unialgal Microcystis isolated from Lake Kasumigaura. Jpn. J. Water Poll. Res., 7, 496-503 (in Japanese with English summary).
Keywords: Microcystis; bacteria; growth; axenic; algae
Strain(s): 478,  604 

Yagi, O., Hagiwara, T., Takamura, Y., Sudo, R. 1987 Limiting nutrients of algal growth in Lake Kasumigaura. Jpn. J. Water Poll. Res., 10, 115-122 (in Japanese with English summary).
Keywords: Microcystis; blue-green algae; nutrients; algal growth potential
Strain(s): 35,  478 

Yagi, O., Ohkubo, N., Tomioka, N., Okada, M. 1989 Limiting nutrients of algal growth in Ushiku Marsh. Jpn. J. Limnol., 50, 139-148 (in Japanese with English summary).
Keywords: algal growth potential; Microcystis; Selenastrum; nutrient
Strain(s): 35,  478 

Tanabe, Y., Kasai, F., Watanabe, M. M. 2007 Multilocus sequence typing (MLST) reveals high genetic diversity and clonal population structure of the toxic cyanobacterium Microcystis aeruginosa. Microbiology, 153, 3695-3703.
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  933,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254 
PubMed: 17975077
DOI: 10.1099/mic.0.2007/010645-0

Tanabe, Y., Sano, T., Kasai, F., Watanabe, M. M. 2009b Recombination, cryptic clades and neutral molecular divergence of the microcystin synthetase (mcy) genes of toxic cyanobacterium Microcystis aeruginosa. BMC Evol. Biol., 9, 115 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254,  2465,  2466,  2467,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2561 
PubMed: 19463155
DOI: 10.1186/1471-2148-9-115

Tanabe, Y. & Watanabe, M. M. 2011 Local expansion of a panmictic lineage of water bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa. PLoS One, 6, e17085 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1173,  1174,  1175,  1176,  1177,  1179,  1180,  1181,  1183,  1184,  1185,  1186,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254,  2088,  2089,  2090,  2091,  2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2493,  2494,  2495,  2496,  2542,  2543,  2544,  2545,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2591,  2592,  2593,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2609,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2627,  2628,  2629 
PubMed: 21390221
DOI: 10.1371/journal.pone.0017085

Sun, L.W., Jiang, W.J., Sato, H., Kawachi, M., Lu, X.W. 2016 Rapid classification and identification of Microcystis aeruginosa strains using MALDI-TOF MS and polygenetic analysis. PLoS One, 11, e0156275 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  100,  101,  104,  105,  107,  109,  111,  112,  478,  604,  843,  901,  1043,  1053,  1058,  1061,  1068,  1069,  1070,  1072,  1076,  1077,  1085,  1094,  1099,  1101,  1104,  1105,  1113,  1115,  1126,  1134,  1135,  1144,  1151,  1157,  1170,  1211,  1213,  1215,  1216,  1217,  1218,  1222,  1224,  1230,  1232,  1233,  1239 
PubMed: 27227555
DOI: 10.1371/journal.pone.0156275

Tanabe, Y., Hodoki, Y., Sano, T., Tada, K., Watanabe, MM. 2018a Adaptation of the freshwater bloom-forming cyanobacterium Microcystis aeruginosa to brackish water is driven by recent horizontal transfer of sucrose genes. Front. Microbiol., 9, 1150 (article ID).
Keywords: Microcystis; bloom; salt tolerance; sucrose; genomics; brackish water; horizontal gene trasnfer; ecotype
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  107,  108,  109,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1052,  1059,  1063,  1067,  1069,  1070,  1075,  1076,  1085,  1093,  1094,  1098,  1100,  1101,  1102,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1128,  1130,  1131,  1132,  1134,  1139,  1141,  1142,  1143,  1144,  1150,  1170,  1174,  1175,  1176,  1177,  1179,  1181,  1183,  1185,  1211,  1213,  1214,  1215,  1232,  1234,  1238,  1239,  1252,  2088,  2090,  2091,  2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2494,  2495,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2592,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2628,  2629,  4234 
PubMed: 29922255
DOI: 10.3389/fmicb.2018.01150

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Keywords: Microcystis aeruginosa; Lectin; Iron uptake; Toxin production; Polysaccharide
Strain(s): 478 
PubMed: 31097253
DOI: 10.1016/j.hal.2019.01.003

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Keywords: cyanobacteria; MALDI Biotyper; microcystins; profiling
Strain(s): 27,  39,  42,  73,  81,  87,  89,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  107,  111,  112,  207,  208,  230,  266,  298,  416,  433,  478,  510,  512,  515,  592,  593,  604,  611,  808,  809,  835,  843,  846,  847,  905,  928,  931,  932,  945,  981,  989,  1025,  1043,  1058,  1061,  1064,  1068,  1069,  1071,  1076,  1085,  1099,  1101,  1105,  1113,  1115,  1126,  1133,  1134,  1135,  1144,  1157,  1215,  1642,  1643,  1652,  1668,  1672,  1673,  1677,  1678,  1698,  2087,  2131,  2412,  2665,  3708,  3733,  3734,  3736,  3755,  3756,  3757 
PubMed: 32501712
DOI: 10.1021/jasms.0c00148

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