Strain Data
Strain number NIES-99  
Phylum Cyanophyta  
Class Cyanophyceae  
Scientific name Microcystis aeruginosa (Kützing) Lemmermann  
Synonym Microcystis ichthyoblabe Kützing; Microcystis novacekii (Komárek) Compère; Microcystis viridis (A.Brown) Lemmermann; Microcystis wesenbergii Komárek  
Former name Microcystis aeruginosa (Kützing) Lemmermann f. aeruginosa  
Common name Blue-green alga ; Cyanobacteria  
Locality (Date of collection) Lake Suwa, Nagano, Japan (1982-08-**)  
Latitude / Longitude 36.04954369 / 138.08476235 
Habitat (Isolation source) Freshwater (Lake water)  
History < Watanabe, Makoto M.  
Isolator (Date of isolation) Watanabe, Michiko H. (1982-08-**)  
Identified by Watanabe, Michiko H.  
State of strain Cryopreservation; Unialgal; Clonal; Non-axenic  
Culture condition
(Preculture condition) 		Medium:  MA  
Temperature:  25 C
Light intensity:  20-30 µmol photons/m2/sec, L/D cycle:  10L:14D
Duration:  20 D  
Gene information 16S rRNA ( AB023258 ) , cpcB, cpcA ( AF385385 ) , ftsZ ( AB324856 ) , glnA ( AB324935 ) , gltX ( AB325014 ) , gyrB ( AB325093 ) , mdnB ( FN668543 ) , pgi ( AB325172 ) , recA ( AB325251 ) , tpi ( AB325330 )  
Cell size (min - max)  
Organization  
Characteristics Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST7 (Tanabe et al. 2007)  
Other strain no. Other strain no. : S-MA-S5  
Remarks Cryopreserved 
Movie  
Related strain information
(Large number of orders and same genus or species)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-298
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST60 (Tanabe et al. 2007) ; Draft genome sequence (Rhee et al. 2012)  
NIES-44
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater Cyanobacterial water bloom (aoko) ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Okano et al. 2015)  
NIES-87
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; ST1 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2018)  
NIES-843
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Offensive odor ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Planktonic ; Type strain (Otsuka et al. 2001) ; Genome decoded strain (Kaneko et al. 2007) ; ST18 (Tanabe et al. 2007)  
NIES-102
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2020) ; ST10 (Tanabe et al. 2007)  
Related strain information
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Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-98
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; microcystin (-) ; ST6 (Tanabe et al. 2007) ; Genome decoded strain (Yamaguchi et al. 2016)  
NIES-90
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Toxicity ; microcystin (+) (Tanabe et al. 2009b) ; ST5 (Tanabe et al. 2007)  
Related strain information
(Used in same reference)
Strain number Scientific name Common name Habitat (Isolation source) Characteristics
NIES-2482
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator ; ST111 (Tanabe et al. 2009a)  
NIES-646
 		Gonium pectorale Green alga   Freshwater (Pond sediment) Phototaxis ; Heterothallic ; Isogamous ; Mating type (−)  
NIES-54
 		Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex Desmid   Freshwater (Paddy water) Heterothallic: Mating type (−) ; Mating group II A  
NIES-2545
 		Microcystis aeruginosa Blue-green alga ; Cyanobacteria   Freshwater (Lake water) Cyanobacterial water bloom (aoko) ; Indicator, Toxicity ; ST106 (Tanabe et al. 2011)  
NIES-421
 		Carteria crucifera Green alga   Freshwater (Sediment)  
Reference
Ishida, K., Matsuda, H., Murakami, M. 1998 Four new microginins, linear peptides from the cyanobacterium Microcystis aeruginosa. Tetrahedron, 54, 13475-13484.
Strain(s): 99,  299 
DOI: 10.1016/S0040-4020(98)00826-6

Jang, M-H., Ha, K., Joo, G-J., Takamura, N. 2003 Toxin production of cyanobacteria is increased by exposure to zooplankton. Freshw. Biol., 48, 1540-1550.
Keywords: info-chemicals; microcystin production; Microcystis aeruginosa; zooplankton; zooplankton culture media filtrate
Strain(s): 44,  87,  88,  99 
DOI: 10.1046/j.1365-2427.2003.01107.x

Kondo, R., Kagiya, G., Hiroishi, S., Watanabe, M. 2000 Genetic typing of a bloom-forming cyanobacterial genus Microcystis in Japan using 16S rRNA gene sequence analysis. Plankton Biol. Ecol., 47, 1-6.
Keywords: genetic typing; 16S rDNA; Microcystis; cyanobacteria; phylogenetic analysis
Strain(s): 87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  104,  105,  106,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  604,  1055,  1061,  1068,  1076,  1090,  1091,  1105,  1122,  1142,  1164 

Kondo, R., Kagiya, G., Hiroishi, S., Watanabe, M., Hata, Y. 1999 Rapid DNA extraction from a bloom-forming cyanobacterium. Microbes Environ., 14, 157-161.
Keywords: DNA extraction; PCR; Microcystis; cyanobacteria
Strain(s): 87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  104,  105,  106,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  604,  1055,  1061,  1068,  1076,  1090,  1091,  1105,  1122,  1142,  1164 
DOI: 10.1264/jsme2.14.157

Kondo, R., Kagiya, G., Komura, M., Yuki, Y., Hiroishi, S., Watanabe, M. 2000 Molecular taxonomy of a bloom-forming cyanobacterial genus Microcystis. Bull. Plankton Soc. Japan, 47, 25-33 (in Japanese with English summary).
Keywords: cyanobacteria; Microcystis; bacterial criteria; molecular analysis
Strain(s): 6,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  104,  105,  106,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  604,  1055,  1061,  1068,  1076,  1090,  1091,  1105,  1122,  1142,  1164 

Kondo, R., Kagiya, G., Yuki, Y., Hiroishi, S., Watanabe, M. 1998 Taxonomy of a bloom-forming cyanobacterial genus Microcystis. Nippon Suisan Gakkaishi, 64, 291-292 (in Japanese with English title).
Strain(s): 87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  604 

Mori, F., Erata, M., Watanabe, M. M. 2002 Cryopreservation of cyanobacteria and green algae in the NIES-Collection. Microbiol. Cult. Coll., 18, 45-55.
Keywords: cryopreservation; cyanobacteria; green algae; FDA staining method; NIES-Collection
Strain(s): 19,  21,  22,  23,  24,  25,  26,  27,  28,  29,  30,  31,  32,  33,  34,  35,  36,  37,  38,  39,  40,  41,  44,  45,  46,  50,  51,  52,  53,  54,  55,  56,  58,  59,  60,  61,  62,  63,  64,  65,  66,  67,  68,  69,  70,  73,  74,  75,  76,  77,  78,  79,  80,  81,  87,  89,  90,  91,  92,  93,  94,  95,  96,  97,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  119,  120,  122,  123,  125,  127,  128,  129,  130,  131,  132,  133,  134,  135,  137,  138,  139,  144,  147,  151,  152,  153,  154,  155,  156,  157,  158,  159,  160,  162,  163,  164,  165,  166,  167,  168,  170,  171,  172,  173,  174,  175,  176,  177,  178,  179,  180,  181,  182,  183,  185,  186,  187,  188,  189,  191,  192,  193,  194,  197,  198,  199,  200,  201,  202,  203,  204,  205,  206,  207,  208,  209,  210,  211,  212,  213,  214,  215,  216,  217,  224,  226,  227,  228,  229,  230,  231,  232,  241,  242,  243,  244,  245,  246,  248,  257,  259,  261,  263,  266,  267,  268,  287,  288,  289,  290,  294,  295,  297,  298,  299,  300,  301,  302,  303,  305,  306,  308,  309,  310,  312,  313,  329,  334,  337,  338,  339,  340,  341,  342,  349,  351,  359,  360,  361,  362,  375,  378,  379,  380,  382,  384,  385,  390,  394,  396,  397,  398,  415,  416,  418,  419,  421,  422,  423,  424,  425,  426,  427,  428,  429,  430,  431,  432,  433,  434,  436,  437,  438,  439,  440,  446,  447,  448,  449,  450,  451,  452,  453,  454,  455,  456,  457,  458,  459,  460,  464,  468,  469,  474,  478,  479,  480,  481,  503,  504,  505,  506,  507,  509,  510,  512,  514,  515,  522,  523,  524,  527,  528,  529,  530,  531,  532,  536,  537,  538,  539,  540,  541,  542,  543,  544,  545,  546,  564,  565,  566,  567,  568,  569,  570,  571,  572,  573,  574,  575,  576,  577,  578,  579,  580,  581,  582,  583,  584,  585,  592,  593,  594,  595,  596,  597,  598,  604,  610,  628,  630,  631,  632,  633,  634,  635,  636,  637,  638,  639,  640,  641,  642,  643,  644,  645,  646,  647,  648,  649,  650,  651,  652,  653,  654,  655,  656,  657,  658,  659,  660,  661,  662,  663,  664,  665,  666,  667,  672,  685,  686,  687,  688,  689,  690,  691,  692,  693,  694,  717,  718,  719,  720,  721,  722,  723,  724,  725,  726,  727,  728,  729 

Watanabe, M. M., Kasai, F., Hiwatari, T., Suda, S., Nei, T. 1984 Cryopreservation of microalgae in liquid nitrogen - Survival of algal cultures after freezing. Jpn. J. Freez. Dry., 30, 23-26 (in Japanese with English title).
Strain(s): 18,  19,  21,  24,  26,  29,  31,  39,  40,  41,  44,  45,  46,  50,  73,  74,  75,  76,  77,  80,  81,  87,  88,  89,  90,  91,  93,  95,  98,  99,  100,  101,  120,  122,  131,  135,  137,  144,  151,  204,  207,  213,  257,  263,  379,  415,  2219,  2235,  2239,  2579 

Yamamoto, Y. & Suzuki, K. 1990 Distribution and algal-lysing activity of fruiting myxobacteria in Lake Suwa. J. Phycol., 26, 457-462.
Keywords: algal-lysing activity; cyanobacteria; fruiting myxobacteria
Strain(s): 19,  40,  44,  99,  102,  112 
DOI: 10.1111/j.0022-3646.1990.00457.x

Yuki, Y., Yoshida, T., Hiroishi, S. 2002 Molecular detection of the toxic cyanobacteria [Yûdoku aoko no bunshi-shikibetsu to yosatsu he-no ôyô]. In Series of Fisheries Science Vol. 143, Prevention and Extermination Strategies of Harmful Algal Blooms [Suisan-gaku shirîzu 134, Yûgai-yûdoku sôrui burûmu no yobô to kujo] , Eds. by Hiroishi, S., Imai, I. & Ishimaru, T., Koseisha-Koseikaku, Tokyo, pp. 43-53 (in Japanese).
Strain(s): 73,  81,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  104,  105,  106,  108,  109,  110,  111,  112,  204,  230,  298,  299,  604 

Jang, M. H., Ha, K., Lucas, M. C., Joo, G. J., Takamura, N. 2004 Changes in microcystin production by Microcystis aeruginosa exposed to phytoplanktivorous and omnivorous fish. Aquat. Toxicol., 68, 51-59.
Keywords: Microcystis aeruginosa; microcystin; fish-induced defence; chemical cues; Hypophthalmichthys molitrix; Carassius gibelio langsdorfi
Strain(s): 44,  88,  99 
PubMed: 15110469
DOI: 10.1016/j.aquatox.2004.02.002

Tanabe, Y., Kasai, F., Watanabe, M. M. 2007 Multilocus sequence typing (MLST) reveals high genetic diversity and clonal population structure of the toxic cyanobacterium Microcystis aeruginosa. Microbiology, 153, 3695-3703.
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  933,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254 
PubMed: 17975077
DOI: 10.1099/mic.0.2007/010645-0

Tanabe, Y., Sano, T., Kasai, F., Watanabe, M. M. 2009b Recombination, cryptic clades and neutral molecular divergence of the microcystin synthetase (mcy) genes of toxic cyanobacterium Microcystis aeruginosa. BMC Evol. Biol., 9, 115 (article ID).
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254,  2465,  2466,  2467,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2520,  2561 
PubMed: 19463155
DOI: 10.1186/1471-2148-9-115

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Strain(s): 19,  24,  81,  99,  102,  107,  204 
PubMed: 10383979
DOI: 10.1128/JB.181.13.4089-4097.1999

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Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109,  110,  111,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1051,  1052,  1053,  1054,  1055,  1056,  1057,  1058,  1059,  1060,  1061,  1062,  1063,  1064,  1065,  1066,  1067,  1068,  1069,  1070,  1072,  1075,  1076,  1077,  1085,  1090,  1091,  1092,  1093,  1094,  1095,  1096,  1097,  1098,  1100,  1101,  1102,  1103,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1123,  1124,  1125,  1126,  1127,  1128,  1129,  1130,  1131,  1132,  1133,  1134,  1135,  1136,  1137,  1138,  1139,  1140,  1141,  1142,  1143,  1144,  1145,  1146,  1147,  1148,  1149,  1150,  1151,  1152,  1153,  1155,  1156,  1157,  1159,  1160,  1161,  1162,  1163,  1164,  1170,  1171,  1172,  1173,  1174,  1175,  1176,  1177,  1179,  1180,  1181,  1183,  1184,  1185,  1186,  1209,  1211,  1213,  1214,  1215,  1216,  1217,  1218,  1219,  1220,  1221,  1222,  1223,  1224,  1225,  1226,  1227,  1228,  1229,  1230,  1231,  1232,  1233,  1234,  1235,  1236,  1237,  1238,  1239,  1240,  1241,  1242,  1243,  1244,  1245,  1251,  1252,  1253,  1254,  2088,  2089,  2090,  2091,  2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2474,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2493,  2494,  2495,  2496,  2519,  2520,  2521,  2522,  2542,  2543,  2544,  2545,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2591,  2592,  2593,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2609,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2627,  2628,  2629 
PubMed: 21390221
DOI: 10.1371/journal.pone.0017085

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Keywords: Microcystis; quantification; SYBR Green I; DNA extraction; eutrophic lake
Strain(s): 98,  99,  204,  604,  611,  843,  946,  961 
DOI: 10.1264/jsme2.ME08515

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Keywords: cyanobacteria; Microcystis; cyanophage; insertion sequence; horizontal gene transfer
Strain(s): 90,  91,  98,  99,  101,  102,  112,  298,  604,  843,  1058,  1067,  1070,  1086,  1098,  1105 
DOI: 10.1264/jsme2.ME10125

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Keywords: Microcystis; bloom; salt tolerance; sucrose; genomics; brackish water; horizontal gene trasnfer; ecotype
Strain(s): 44,  87,  88,  89,  90,  91,  98,  99,  100,  101,  102,  103,  104,  105,  107,  108,  109,  112,  298,  299,  478,  604,  843,  901,  1050,  1052,  1059,  1063,  1067,  1069,  1070,  1075,  1076,  1085,  1093,  1094,  1098,  1100,  1101,  1102,  1104,  1105,  1106,  1107,  1108,  1113,  1114,  1115,  1122,  1128,  1130,  1131,  1132,  1134,  1139,  1141,  1142,  1143,  1144,  1150,  1170,  1174,  1175,  1176,  1177,  1179,  1181,  1183,  1185,  1211,  1213,  1214,  1215,  1232,  1234,  1238,  1239,  1252,  2088,  2090,  2091,  2465,  2466,  2467,  2468,  2469,  2470,  2471,  2472,  2473,  2475,  2476,  2477,  2478,  2479,  2480,  2481,  2482,  2483,  2484,  2485,  2486,  2487,  2488,  2489,  2490,  2491,  2492,  2494,  2495,  2546,  2547,  2548,  2549,  2550,  2551,  2552,  2553,  2554,  2555,  2556,  2557,  2558,  2559,  2560,  2561,  2592,  2594,  2595,  2596,  2597,  2598,  2599,  2600,  2601,  2602,  2603,  2604,  2605,  2606,  2607,  2608,  2610,  2611,  2612,  2613,  2617,  2618,  2619,  2620,  2621,  2622,  2623,  2624,  2625,  2626,  2628,  2629,  4234 
PubMed: 29922255
DOI: 10.3389/fmicb.2018.01150

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